Compases 43 a 81

En el compás 43 comienza un largo episodio (43 a 60) que nos lleva a otra presentación del sujeto. Esta vez el orden de entrada de las voces se invierte, comenzando con el bajo seguido de tenor, alto y soprano. Estos sujetos han sido transformados melódicamente. Comparamos a continuación el sujeto presentado por el alto (primer ejemplo) con el sujeto original (segundo ejemplo). Vemos un cambio de dos de los intervalos de segunda del sujeto original por intervalos de tercera. Como resultado la parte señalada del sujeto variado estará una segunda más aguda que el original:

Al llegar al compás 61 la tonalidad de fa mayor está establecida. El sujeto del bajo (luego del primer fa) es un arpegio del acorde de dominante de fa (do - mi - sol - sib). El uso del motivo ai por la soprano y el alto introduce disonancias y contribuye a la complejidad armónica del pasaje. En la soprano el motivo fa - mi - re# - mi refuerza la tercera del acorde de dominante, pero el fa y el re# ayudan al carácter disonante del pasaje. Igualmente con el motivo en el alto. El re bemol es la novena menor del acorde de dominante de fa menor, pero el si natural choca con el si bemol propio del acorde de dominante. El acorde de do dominante es usado como IV grado de sol menor y encadenado con la dominante de esa tonalidad para finalizar en sol menor. Note que luego de llegar a sol menor las voces superiores insisten el uso del motivo ai. Sobre todo el la bemol del alto es altamente disonante e inusual:

En la presentación del sujeto por el tenor, Bach insiste en el choque ya mencionado del la bemol sobre el acorde de sol menor y mantiene la armonía de tónica antes de encadenar con un acorde de mi dominante donde el fa del sujeto se convierte en novena menor del acorde que encadena con la novena dominante de re (compás 68). Un corto episodio que contrasta por su diatonismo (un ciclo de quintas) afirma la tonalidad de re menor para la presentación del sujeto en el alto en el compás 73:

El alto presenta el sujeto en re menor repitiendo el plan armónico anterior. El do natural del sujeto se convierte en la novena menor del acorde de dominante de mi. Resolverá a mi dominante para preparar la presentación del sujeto por la soprano en la tonalidad de la menor. Para esta presentación Bach hace una variación al esquema armónico, precediendo el esperado acorde de fa# dominante de si de un acorde de fa# semidisminuido (séptima de sensible):